2018年36期

盐胁迫下不同品种水稻的基因表达

作  者 朱长保,徐辰峰,李均乾,刘仁梅,孙高宝
第一作者 朱长保
作者单位 金湖县植保植检站,江苏淮安
卷  号 47
发表年份 2018
发表刊期 36
发表页面 18-20,28
关  键  字 水稻;盐胁迫;差异基因表达
摘  要 [目的]初步探索水稻耐盐机制,筛选关键基因。 [方法]从公共基因芯片数据库GEO(Gene Expression Omnibus)搜索有关盐胁迫下水稻基因表达的数据,利用 TAC(Transcriptome Analysis Console)筛选表达差异基因,对差异基因进行GO(Gene Ontology)富集分析、信号通路富集分析。[结果]在盐胁迫下,CSR11、PL177两种耐受型水稻与IR64、VSR156两种敏感型水稻分别有3 289、1 934、1 806、4 426个基因表达。耐受型水稻中同时上调或下调的基因有288个,敏感型水稻中同时上调或下调的基因有330个。通过生物信息学研究发现,耐受型水稻盐胁迫主要影响代谢途径、次级代谢产物合成、转录因子等方面。敏感型水稻盐胁迫影响主要影响胁迫响应、激素转导、物质代谢等方面。[结论] 利用生物信息学方法能有效筛选目标基因,并可为进一步研究提供依据。
附  件 盐胁迫下不同品种水稻的基因表达
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