2020年18期

红鳍东方鲀与杂交鲀的性腺转录组比较分析

作  者 荆笛,张钰渤,刘圣聪,刘福君,王秀利
第一作者 荆笛
作者单位 大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连
卷  号 48
发表年份 2020
发表刊期 18
发表页面 112-116
关  键  字 红鳍东方鲀;菊黄东方鲀;性腺;转录组;高通量测序
摘  要 为分析红鳍东方鲀与杂交鲀(菊黄东方鲀♀×红鳍东方鲀♂)性腺发育的分子机制,该研究应用Illumina高通量测序技术对二者的卵巢和精巢组织进行转录组测序与生物信息学分析。结果表明:通过分析与筛选共得到差异表达基因(DEGs)4 157个(卵巢组织)和8 260个(精巢组织)。其中卵巢组织样本(O_2vsO_1)中表达上调的差异基因有1 912个,表达下调的有2 245个;精巢组织样本(T_2vsT_1)中表达上调的差异基因有4 234个,表达下调的有4 026个。通过GO功能注释与KEGG富集分析,在卵巢组织样本中(O_2vsO_1),差异表达基因主要归纳为93个功能类别与153条代谢通路;在精巢组织中(T_2vsT_1),差异表达基因可以主要归纳为73个功能类别与154条代谢通路,其中神经活性配体-受体相互作用过程、丝裂原活化蛋白激酶通路和钙信号通路的富集程度最高。该研究结果丰富了红鳍东方鲀与杂交鲀的转录组信息,为后续相关研究提供了大量有价值的转录组数据。
附  件 红鳍东方鲀与杂交鲀的性腺转录组比较分析
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