2020年19期

脊尾白虾低盐转录组信息挖掘

作  者 沈晔,王兴强,曹梅,郑年昊,陈百尧
第一作者 沈晔
作者单位 江苏海洋大学海洋生命与水产学院,江苏连云港
卷  号 48
发表年份 2020
发表刊期 19
发表页面 89-96
关  键  字 脊尾白虾;低盐胁迫;转录组
摘  要 通过前期对自然海水组(盐度31.0)和淡水组(盐度0.2)脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)转录组的测序及分析,筛选出低盐胁迫下差异表达显著的基因并进行实时定量验证,同时进行KEGG通路富集分析,挖掘低盐胁迫相关信号通路,以期阐明脊尾白虾在低盐环境下的生理调控机制。转录组数据分析发现,脊尾白虾机体可能通过磺基转移酶活性的变化来调控类固醇、激素水平。表皮蛋白AMP5样的表达量的变化表明低盐胁迫可能影响脊尾白虾节间膜的形成。低盐胁迫试验实时定量结果显示,基因在鳃、肝胰腺和肌肉中的表达情况各有不同,并随时间的变化,基因的表达量也会有所波动。Hedgehog信号通路分析发现,低盐度胁迫条件下脊尾白虾C型凝集素和低密度脂蛋白受体相关蛋白表达上调,推测机体通过调控C型凝集素和低密度脂蛋白受体相关蛋白,促进低密度脂蛋白的代谢,水解得到的胆固醇与Smo结合,激活Hedgehog信号通路,以响应低盐胁迫。该研究挖掘了差异表达基因相关信号通路,推测低盐胁迫可能通过调控代谢相关酶的活性来促进脊尾白虾的生长代谢,并且低盐胁迫可能影响神经递质的调控过程。
附  件 脊尾白虾低盐转录组信息挖掘
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