2018年08期

野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌多样性研究

作  者 兰阿峰,杨曼,郭素芬,邓百万
第一作者 兰阿峰
作者单位 陕西理工学院生物科学与工程学院,陕西汉中
卷  号 46
发表年份 2018
发表刊期 8
发表页面 88-91
关  键  字 野生秦岭羚牛;瘤胃;产甲烷古菌;分子多样性,
摘  要 [目的]了解野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌的组成及其多样性。[方法]提取野生秦岭羚牛瘤胃内容物总DNA,选用产甲烷菌特异性引物 Met86F和Met1340R,对总DNA进行16S rRNA特异性扩增,构建秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌16S rRNA克隆文库,对阳性克隆进行PCR-RFLP(限制性内切酶片段长度多态性)分析,并对Hae Ⅲ 酶切带谱不同的菌液进行测序,构建系统发育树。[结果]根据酶切带谱分析和测序结果的不同,将随机挑取的105个阳性克隆归为14个不同的可操作分类单元(OTUs)。系统发育分析表明,这些克隆序列均位于广域古菌门(Euryarchaeota),隶属甲烷杆菌科(Methanobacteriaceae,65.71%)、Methanomassiliicoccus(29.52%)和Methanosarcinaceae(4.76%)3个科。其中有57个序列与可培养菌相似度在97%以上,分属于Methanobrevibacter millerae、Methanobrevibacter olleyae 和Methanobrevibacter thaueri。其余48个序列与未培养菌相似度较高,占11个OTUs。[结论]野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌多样性比较丰富,且可能存在新的分类单元。
附  件 野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌多样性研究
注:若需下载,请右键单击另存
点击关闭

在线客服

服务热线:0551-65160973

二维码